Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms