Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
HMGB2P26583 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms