Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR2AP24928 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms