Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNCP24863 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNCP24863 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNCP24863 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNCP24863 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNCP24863 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNCP24863 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNCP24863 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNCP24863 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNCP24863 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNCP24863 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNCP24863 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNCP24863 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNCP24863 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNCP24863 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNCP24863 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNCP24863 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNCP24863 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNCP24863 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNCP24863 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNCP24863 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNCP24863 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNCP24863 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNCP24863 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNCP24863 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNCP24863 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNCP24863 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNCP24863 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNCP24863 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNCP24863 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNCP24863 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNCP24863 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNCP24863 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNCP24863 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCNCP24863 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCNCP24863 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNCP24863 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNCP24863 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNCP24863 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNCP24863 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNCP24863 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNCP24863 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNCP24863 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNCP24863 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNCP24863 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNCP24863 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNCP24863 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNCP24863 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNCP24863 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNCP24863 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNCP24863 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNCP24863 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNCP24863 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNCP24863 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNCP24863 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNCP24863 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNCP24863 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNCP24863 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNCP24863 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNCP24863 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNCP24863 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNCP24863 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNCP24863 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNCP24863 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNCP24863 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNCP24863 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNCP24863 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNCP24863 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNCP24863 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNCP24863 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNCP24863 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNCP24863 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNCP24863 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNCP24863 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNCP24863 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNCP24863 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNCP24863 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNCP24863 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNCP24863 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNCP24863 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNCP24863 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNCP24863 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNCP24863 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNCP24863 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNCP24863 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNCP24863 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNCP24863 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNCP24863 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNCP24863 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNCP24863 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNCP24863 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNCP24863 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNCP24863 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNCP24863 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNCP24863 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNCP24863 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNCP24863 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNCP24863 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNCP24863 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNCP24863 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms