Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA6P23229 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ITGA6P23229 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGA6P23229 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms