Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGFR3P22607 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGFR3P22607 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGFR3P22607 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms