Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD53P19397 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD53P19397 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CD53P19397 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CD53P19397 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD53P19397 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD53P19397 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD53P19397 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD53P19397 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD53P19397 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CD53P19397 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD53P19397 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD53P19397 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD53P19397 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD53P19397 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD53P19397 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD53P19397 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD53P19397 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD53P19397 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD53P19397 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD53P19397 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD53P19397 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD53P19397 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD53P19397 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD53P19397 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CD53P19397 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD53P19397 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD53P19397 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD53P19397 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD53P19397 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD53P19397 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD53P19397 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD53P19397 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD53P19397 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD53P19397 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD53P19397 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD53P19397 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD53P19397 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD53P19397 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD53P19397 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD53P19397 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD53P19397 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD53P19397 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD53P19397 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD53P19397 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD53P19397 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD53P19397 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD53P19397 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD53P19397 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD53P19397 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD53P19397 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD53P19397 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD53P19397 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD53P19397 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD53P19397 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CD53P19397 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD53P19397 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD53P19397 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD53P19397 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD53P19397 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD53P19397 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD53P19397 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD53P19397 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CD53P19397 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD53P19397 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD53P19397 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD53P19397 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD53P19397 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD53P19397 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD53P19397 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD53P19397 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD53P19397 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD53P19397 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD53P19397 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD53P19397 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD53P19397 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD53P19397 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD53P19397 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD53P19397 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD53P19397 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD53P19397 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD53P19397 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD53P19397 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD53P19397 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD53P19397 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD53P19397 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD53P19397 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD53P19397 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD53P19397 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD53P19397 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CD53P19397 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD53P19397 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD53P19397 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD53P19397 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD53P19397 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD53P19397 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD53P19397 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD53P19397 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD53P19397 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD53P19397 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms