Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDCP19113 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDCP19113 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDCP19113 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDCP19113 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HDCP19113 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDCP19113 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HDCP19113 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDCP19113 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDCP19113 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDCP19113 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDCP19113 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDCP19113 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDCP19113 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDCP19113 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDCP19113 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HDCP19113 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HDCP19113 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDCP19113 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HDCP19113 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDCP19113 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDCP19113 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDCP19113 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDCP19113 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDCP19113 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDCP19113 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDCP19113 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HDCP19113 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDCP19113 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDCP19113 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDCP19113 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDCP19113 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDCP19113 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDCP19113 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDCP19113 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDCP19113 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDCP19113 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDCP19113 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDCP19113 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDCP19113 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDCP19113 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDCP19113 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDCP19113 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDCP19113 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDCP19113 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDCP19113 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDCP19113 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDCP19113 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDCP19113 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDCP19113 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDCP19113 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDCP19113 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDCP19113 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HDCP19113 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDCP19113 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDCP19113 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
HDCP19113 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDCP19113 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDCP19113 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDCP19113 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDCP19113 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDCP19113 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDCP19113 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDCP19113 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDCP19113 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDCP19113 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDCP19113 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDCP19113 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDCP19113 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDCP19113 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDCP19113 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDCP19113 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDCP19113 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDCP19113 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDCP19113 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDCP19113 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDCP19113 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDCP19113 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDCP19113 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDCP19113 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDCP19113 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HDCP19113 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDCP19113 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDCP19113 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDCP19113 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDCP19113 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDCP19113 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDCP19113 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDCP19113 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDCP19113 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDCP19113 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDCP19113 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDCP19113 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDCP19113 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDCP19113 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDCP19113 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HDCP19113 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDCP19113 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDCP19113 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDCP19113 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms