Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARF4P18085 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARF4P18085 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARF4P18085 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARF4P18085 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARF4P18085 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARF4P18085 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARF4P18085 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARF4P18085 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARF4P18085 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARF4P18085 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARF4P18085 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARF4P18085 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARF4P18085 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARF4P18085 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARF4P18085 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARF4P18085 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARF4P18085 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARF4P18085 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARF4P18085 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARF4P18085 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARF4P18085 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARF4P18085 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARF4P18085 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARF4P18085 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARF4P18085 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARF4P18085 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARF4P18085 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARF4P18085 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARF4P18085 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARF4P18085 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARF4P18085 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARF4P18085 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ARF4P18085 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARF4P18085 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARF4P18085 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARF4P18085 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARF4P18085 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARF4P18085 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARF4P18085 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARF4P18085 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARF4P18085 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARF4P18085 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARF4P18085 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARF4P18085 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARF4P18085 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARF4P18085 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARF4P18085 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARF4P18085 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARF4P18085 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARF4P18085 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARF4P18085 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARF4P18085 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARF4P18085 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARF4P18085 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARF4P18085 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARF4P18085 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARF4P18085 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARF4P18085 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARF4P18085 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARF4P18085 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARF4P18085 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARF4P18085 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARF4P18085 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARF4P18085 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARF4P18085 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARF4P18085 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARF4P18085 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARF4P18085 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARF4P18085 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARF4P18085 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARF4P18085 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARF4P18085 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARF4P18085 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARF4P18085 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARF4P18085 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARF4P18085 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARF4P18085 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARF4P18085 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARF4P18085 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARF4P18085 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARF4P18085 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARF4P18085 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARF4P18085 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARF4P18085 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARF4P18085 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARF4P18085 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARF4P18085 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARF4P18085 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARF4P18085 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARF4P18085 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARF4P18085 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARF4P18085 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARF4P18085 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARF4P18085 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARF4P18085 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARF4P18085 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARF4P18085 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARF4P18085 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARF4P18085 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.2 ms