Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD1P17405 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms