Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTLA4P16410 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms