Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOLR1P15328 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms