Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPA1P15085 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPA1P15085 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPA1P15085 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPA1P15085 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPA1P15085 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPA1P15085 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPA1P15085 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPA1P15085 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPA1P15085 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPA1P15085 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPA1P15085 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPA1P15085 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CPA1P15085 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPA1P15085 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPA1P15085 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPA1P15085 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPA1P15085 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPA1P15085 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPA1P15085 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CPA1P15085 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CPA1P15085 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CPA1P15085 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPA1P15085 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CPA1P15085 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CPA1P15085 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CPA1P15085 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CPA1P15085 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CPA1P15085 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CPA1P15085 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CPA1P15085 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CPA1P15085 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CPA1P15085 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPA1P15085 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPA1P15085 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPA1P15085 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CPA1P15085 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPA1P15085 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPA1P15085 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CPA1P15085 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CPA1P15085 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CPA1P15085 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CPA1P15085 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CPA1P15085 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CPA1P15085 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CPA1P15085 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CPA1P15085 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CPA1P15085 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CPA1P15085 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CPA1P15085 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPA1P15085 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPA1P15085 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CPA1P15085 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CPA1P15085 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CPA1P15085 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CPA1P15085 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPA1P15085 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPA1P15085 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CPA1P15085 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CPA1P15085 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CPA1P15085 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPA1P15085 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPA1P15085 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPA1P15085 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CPA1P15085 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CPA1P15085 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CPA1P15085 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPA1P15085 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CPA1P15085 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CPA1P15085 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPA1P15085 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPA1P15085 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPA1P15085 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPA1P15085 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPA1P15085 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPA1P15085 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPA1P15085 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPA1P15085 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPA1P15085 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPA1P15085 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPA1P15085 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPA1P15085 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPA1P15085 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPA1P15085 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPA1P15085 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPA1P15085 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPA1P15085 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPA1P15085 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPA1P15085 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPA1P15085 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPA1P15085 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPA1P15085 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPA1P15085 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPA1P15085 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPA1P15085 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPA1P15085 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPA1P15085 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPA1P15085 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPA1P15085 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPA1P15085 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms