Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX4I1P13073 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms