Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PF4V1P10720 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms