Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM200BP0CF97 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM200BP0CF97 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM200BP0CF97 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms