Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LINC00032P0C843 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00032P0C843 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms