Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRR29P0C7W0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRR29P0C7W0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRR29P0C7W0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRR29P0C7W0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRR29P0C7W0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRR29P0C7W0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRR29P0C7W0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRR29P0C7W0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRR29P0C7W0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRR29P0C7W0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRR29P0C7W0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRR29P0C7W0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRR29P0C7W0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRR29P0C7W0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRR29P0C7W0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRR29P0C7W0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRR29P0C7W0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms