Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTAP09496 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTAP09496 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTAP09496 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTAP09496 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTAP09496 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTAP09496 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTAP09496 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTAP09496 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTAP09496 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTAP09496 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTAP09496 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTAP09496 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTAP09496 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTAP09496 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTAP09496 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTAP09496 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTAP09496 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTAP09496 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTAP09496 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTAP09496 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTAP09496 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTAP09496 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTAP09496 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTAP09496 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTAP09496 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTAP09496 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTAP09496 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTAP09496 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTAP09496 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTAP09496 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTAP09496 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTAP09496 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTAP09496 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTAP09496 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTAP09496 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTAP09496 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTAP09496 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTAP09496 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLTAP09496 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTAP09496 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTAP09496 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTAP09496 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTAP09496 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTAP09496 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTAP09496 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTAP09496 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTAP09496 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTAP09496 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTAP09496 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTAP09496 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTAP09496 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTAP09496 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTAP09496 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTAP09496 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTAP09496 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTAP09496 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTAP09496 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTAP09496 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTAP09496 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTAP09496 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTAP09496 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTAP09496 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTAP09496 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTAP09496 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTAP09496 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTAP09496 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTAP09496 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTAP09496 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTAP09496 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTAP09496 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTAP09496 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTAP09496 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTAP09496 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTAP09496 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTAP09496 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTAP09496 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTAP09496 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTAP09496 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTAP09496 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTAP09496 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTAP09496 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTAP09496 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTAP09496 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTAP09496 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTAP09496 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTAP09496 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTAP09496 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTAP09496 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTAP09496 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTAP09496 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTAP09496 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTAP09496 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTAP09496 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTAP09496 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTAP09496 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTAP09496 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTAP09496 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTAP09496 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLTAP09496 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms