Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP1P09455 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP1P09455 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP1P09455 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP1P09455 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP1P09455 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP1P09455 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP1P09455 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP1P09455 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP1P09455 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP1P09455 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP1P09455 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP1P09455 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP1P09455 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP1P09455 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP1P09455 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP1P09455 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP1P09455 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP1P09455 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP1P09455 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP1P09455 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP1P09455 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP1P09455 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP1P09455 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP1P09455 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP1P09455 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP1P09455 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP1P09455 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP1P09455 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP1P09455 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP1P09455 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP1P09455 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP1P09455 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP1P09455 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP1P09455 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP1P09455 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP1P09455 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP1P09455 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP1P09455 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP1P09455 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP1P09455 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP1P09455 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP1P09455 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP1P09455 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP1P09455 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP1P09455 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP1P09455 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP1P09455 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP1P09455 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP1P09455 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP1P09455 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP1P09455 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP1P09455 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP1P09455 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP1P09455 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP1P09455 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP1P09455 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP1P09455 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP1P09455 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP1P09455 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP1P09455 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP1P09455 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP1P09455 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP1P09455 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP1P09455 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP1P09455 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP1P09455 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP1P09455 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP1P09455 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP1P09455 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP1P09455 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP1P09455 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP1P09455 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP1P09455 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP1P09455 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP1P09455 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP1P09455 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP1P09455 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP1P09455 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP1P09455 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP1P09455 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP1P09455 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP1P09455 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP1P09455 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP1P09455 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP1P09455 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP1P09455 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP1P09455 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP1P09455 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP1P09455 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP1P09455 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP1P09455 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP1P09455 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP1P09455 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP1P09455 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP1P09455 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP1P09455 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP1P09455 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP1P09455 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP1P09455 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms