Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT19P08727 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT19P08727 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT19P08727 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT19P08727 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT19P08727 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT19P08727 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT19P08727 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT19P08727 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT19P08727 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT19P08727 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT19P08727 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT19P08727 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT19P08727 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT19P08727 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT19P08727 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT19P08727 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT19P08727 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT19P08727 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT19P08727 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT19P08727 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT19P08727 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT19P08727 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT19P08727 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT19P08727 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT19P08727 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT19P08727 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT19P08727 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT19P08727 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT19P08727 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT19P08727 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT19P08727 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT19P08727 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT19P08727 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT19P08727 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT19P08727 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT19P08727 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT19P08727 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT19P08727 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT19P08727 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT19P08727 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT19P08727 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT19P08727 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT19P08727 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT19P08727 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT19P08727 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT19P08727 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT19P08727 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT19P08727 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT19P08727 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT19P08727 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT19P08727 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT19P08727 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT19P08727 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT19P08727 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT19P08727 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT19P08727 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT19P08727 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT19P08727 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT19P08727 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT19P08727 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT19P08727 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT19P08727 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT19P08727 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT19P08727 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT19P08727 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT19P08727 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT19P08727 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT19P08727 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT19P08727 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT19P08727 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT19P08727 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT19P08727 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT19P08727 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT19P08727 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT19P08727 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT19P08727 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT19P08727 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT19P08727 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT19P08727 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT19P08727 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT19P08727 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT19P08727 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT19P08727 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT19P08727 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT19P08727 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT19P08727 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT19P08727 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT19P08727 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT19P08727 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT19P08727 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT19P08727 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT19P08727 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT19P08727 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT19P08727 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT19P08727 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT19P08727 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT19P08727 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT19P08727 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT19P08727 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms