Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSLP07711 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSLP07711 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSLP07711 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSLP07711 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSLP07711 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSLP07711 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSLP07711 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSLP07711 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSLP07711 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSLP07711 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSLP07711 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSLP07711 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSLP07711 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSLP07711 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSLP07711 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSLP07711 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSLP07711 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSLP07711 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSLP07711 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSLP07711 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSLP07711 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSLP07711 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSLP07711 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSLP07711 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSLP07711 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSLP07711 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSLP07711 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSLP07711 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSLP07711 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSLP07711 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSLP07711 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSLP07711 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSLP07711 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSLP07711 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSLP07711 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSLP07711 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSLP07711 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSLP07711 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSLP07711 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSLP07711 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSLP07711 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSLP07711 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSLP07711 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSLP07711 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSLP07711 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSLP07711 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSLP07711 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSLP07711 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSLP07711 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSLP07711 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSLP07711 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSLP07711 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSLP07711 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSLP07711 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSLP07711 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSLP07711 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSLP07711 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSLP07711 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSLP07711 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSLP07711 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSLP07711 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSLP07711 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSLP07711 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSLP07711 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSLP07711 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSLP07711 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSLP07711 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSLP07711 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSLP07711 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSLP07711 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSLP07711 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSLP07711 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSLP07711 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSLP07711 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSLP07711 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSLP07711 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSLP07711 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSLP07711 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSLP07711 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSLP07711 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSLP07711 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSLP07711 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSLP07711 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSLP07711 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTSLP07711 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSLP07711 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSLP07711 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSLP07711 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSLP07711 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSLP07711 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSLP07711 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSLP07711 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSLP07711 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSLP07711 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSLP07711 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSLP07711 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSLP07711 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSLP07711 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSLP07711 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms