Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBBP07437 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBBP07437 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBBP07437 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBBP07437 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBBP07437 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBBP07437 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBBP07437 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBBP07437 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBBP07437 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBBP07437 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBBP07437 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBBP07437 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBBP07437 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBBP07437 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBBP07437 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBBP07437 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBBP07437 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBBP07437 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBBP07437 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBBP07437 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBBP07437 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBBP07437 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBBP07437 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBBP07437 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBBP07437 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBBP07437 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBBP07437 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBBP07437 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBBP07437 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBBP07437 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBBP07437 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBBP07437 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBBP07437 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBBP07437 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBBP07437 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBBP07437 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBBP07437 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBBP07437 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBBP07437 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBBP07437 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBBP07437 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBBP07437 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBBP07437 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBBP07437 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBBP07437 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBBP07437 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBBP07437 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBBP07437 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBBP07437 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBBP07437 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBBP07437 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBBP07437 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBBP07437 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBBP07437 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBBP07437 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBBP07437 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBBP07437 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBBP07437 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBBP07437 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBBP07437 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBBP07437 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBBP07437 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBBP07437 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBBP07437 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBBP07437 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBBP07437 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBBP07437 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBBP07437 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBBP07437 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBBP07437 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBBP07437 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBBP07437 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBBP07437 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBBP07437 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBBP07437 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBBP07437 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBBP07437 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBBP07437 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBBP07437 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBBP07437 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBBP07437 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBBP07437 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBBP07437 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBBP07437 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBBP07437 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBBP07437 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBBP07437 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBBP07437 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBBP07437 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBBP07437 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBBP07437 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBBP07437 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBBP07437 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBBP07437 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBBP07437 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBBP07437 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBBP07437 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBBP07437 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBBP07437 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms