Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLK3P07288 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLK3P07288 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLK3P07288 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLK3P07288 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLK3P07288 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLK3P07288 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLK3P07288 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLK3P07288 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLK3P07288 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLK3P07288 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLK3P07288 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLK3P07288 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLK3P07288 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLK3P07288 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLK3P07288 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLK3P07288 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLK3P07288 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLK3P07288 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLK3P07288 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLK3P07288 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLK3P07288 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLK3P07288 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLK3P07288 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLK3P07288 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLK3P07288 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLK3P07288 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLK3P07288 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLK3P07288 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLK3P07288 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLK3P07288 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KLK3P07288 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLK3P07288 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLK3P07288 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLK3P07288 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLK3P07288 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLK3P07288 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLK3P07288 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLK3P07288 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLK3P07288 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLK3P07288 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLK3P07288 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLK3P07288 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLK3P07288 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLK3P07288 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLK3P07288 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLK3P07288 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLK3P07288 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLK3P07288 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLK3P07288 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLK3P07288 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLK3P07288 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLK3P07288 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLK3P07288 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLK3P07288 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLK3P07288 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLK3P07288 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLK3P07288 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLK3P07288 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLK3P07288 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLK3P07288 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLK3P07288 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLK3P07288 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLK3P07288 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KLK3P07288 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLK3P07288 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KLK3P07288 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLK3P07288 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLK3P07288 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLK3P07288 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLK3P07288 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLK3P07288 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLK3P07288 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLK3P07288 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLK3P07288 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLK3P07288 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLK3P07288 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLK3P07288 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLK3P07288 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KLK3P07288 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLK3P07288 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLK3P07288 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLK3P07288 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLK3P07288 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLK3P07288 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLK3P07288 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLK3P07288 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLK3P07288 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLK3P07288 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLK3P07288 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLK3P07288 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLK3P07288 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLK3P07288 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KLK3P07288 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLK3P07288 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLK3P07288 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLK3P07288 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLK3P07288 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLK3P07288 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLK3P07288 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms