Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCCAP05165 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCCAP05165 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCCAP05165 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCCAP05165 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCCAP05165 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCCAP05165 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCCAP05165 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCCAP05165 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCCAP05165 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCCAP05165 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCCAP05165 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCCAP05165 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCCAP05165 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCCAP05165 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCCAP05165 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PCCAP05165 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PCCAP05165 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCCAP05165 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCCAP05165 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCCAP05165 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PCCAP05165 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCCAP05165 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCCAP05165 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCCAP05165 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCCAP05165 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCCAP05165 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCCAP05165 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCCAP05165 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCCAP05165 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCCAP05165 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCCAP05165 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCCAP05165 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCCAP05165 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCCAP05165 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCCAP05165 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCCAP05165 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCCAP05165 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCCAP05165 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCCAP05165 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCCAP05165 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCCAP05165 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCCAP05165 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCCAP05165 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PCCAP05165 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCCAP05165 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCCAP05165 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCCAP05165 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCCAP05165 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCCAP05165 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCCAP05165 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCCAP05165 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCCAP05165 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCCAP05165 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCCAP05165 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCCAP05165 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCCAP05165 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCCAP05165 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCCAP05165 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCCAP05165 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCCAP05165 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCCAP05165 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCCAP05165 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PCCAP05165 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCCAP05165 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCCAP05165 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCCAP05165 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCCAP05165 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCCAP05165 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCCAP05165 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCCAP05165 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCCAP05165 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PCCAP05165 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PCCAP05165 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCCAP05165 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCCAP05165 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCCAP05165 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCCAP05165 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCCAP05165 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCCAP05165 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCCAP05165 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCCAP05165 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCCAP05165 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCCAP05165 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCCAP05165 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCCAP05165 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCCAP05165 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCCAP05165 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCCAP05165 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCCAP05165 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCCAP05165 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCCAP05165 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PCCAP05165 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCCAP05165 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCCAP05165 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
PCCAP05165 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PCCAP05165 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PCCAP05165 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PCCAP05165 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PCCAP05165 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms