Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYCNP04198 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYCNP04198 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYCNP04198 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MYCNP04198 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYCNP04198 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYCNP04198 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYCNP04198 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYCNP04198 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYCNP04198 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MYCNP04198 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MYCNP04198 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYCNP04198 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYCNP04198 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYCNP04198 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYCNP04198 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MYCNP04198 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYCNP04198 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYCNP04198 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYCNP04198 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYCNP04198 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYCNP04198 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MYCNP04198 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MYCNP04198 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MYCNP04198 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYCNP04198 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYCNP04198 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYCNP04198 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYCNP04198 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYCNP04198 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYCNP04198 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYCNP04198 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYCNP04198 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYCNP04198 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYCNP04198 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYCNP04198 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYCNP04198 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYCNP04198 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYCNP04198 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYCNP04198 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYCNP04198 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYCNP04198 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYCNP04198 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MYCNP04198 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYCNP04198 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYCNP04198 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYCNP04198 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYCNP04198 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYCNP04198 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYCNP04198 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYCNP04198 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYCNP04198 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYCNP04198 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYCNP04198 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MYCNP04198 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYCNP04198 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYCNP04198 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYCNP04198 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYCNP04198 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYCNP04198 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYCNP04198 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYCNP04198 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYCNP04198 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYCNP04198 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYCNP04198 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYCNP04198 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYCNP04198 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYCNP04198 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MYCNP04198 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYCNP04198 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYCNP04198 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYCNP04198 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYCNP04198 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYCNP04198 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYCNP04198 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYCNP04198 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYCNP04198 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYCNP04198 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYCNP04198 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYCNP04198 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYCNP04198 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYCNP04198 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYCNP04198 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYCNP04198 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYCNP04198 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYCNP04198 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYCNP04198 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYCNP04198 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYCNP04198 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYCNP04198 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYCNP04198 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYCNP04198 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYCNP04198 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MYCNP04198 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYCNP04198 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYCNP04198 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYCNP04198 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYCNP04198 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYCNP04198 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYCNP04198 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9475.7 ms