Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTNP04004 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTNP04004 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTNP04004 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTNP04004 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTNP04004 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTNP04004 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTNP04004 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTNP04004 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VTNP04004 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VTNP04004 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VTNP04004 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VTNP04004 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VTNP04004 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VTNP04004 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VTNP04004 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTNP04004 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTNP04004 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTNP04004 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTNP04004 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VTNP04004 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VTNP04004 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VTNP04004 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VTNP04004 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VTNP04004 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VTNP04004 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VTNP04004 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTNP04004 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTNP04004 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTNP04004 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTNP04004 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTNP04004 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTNP04004 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTNP04004 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTNP04004 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTNP04004 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTNP04004 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VTNP04004 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTNP04004 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTNP04004 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTNP04004 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTNP04004 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VTNP04004 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VTNP04004 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTNP04004 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTNP04004 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTNP04004 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTNP04004 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTNP04004 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTNP04004 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTNP04004 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTNP04004 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTNP04004 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTNP04004 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTNP04004 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTNP04004 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTNP04004 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTNP04004 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTNP04004 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTNP04004 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VTNP04004 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VTNP04004 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VTNP04004 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VTNP04004 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VTNP04004 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VTNP04004 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTNP04004 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTNP04004 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VTNP04004 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTNP04004 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTNP04004 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTNP04004 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTNP04004 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTNP04004 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTNP04004 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTNP04004 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTNP04004 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTNP04004 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTNP04004 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTNP04004 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTNP04004 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTNP04004 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VTNP04004 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTNP04004 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VTNP04004 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTNP04004 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTNP04004 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VTNP04004 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VTNP04004 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VTNP04004 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VTNP04004 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTNP04004 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTNP04004 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTNP04004 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTNP04004 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTNP04004 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTNP04004 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTNP04004 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTNP04004 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTNP04004 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms