Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A1P02730 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms