Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	MPP10	YJR002W	1782 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	AIM17	YHL021C	1398 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	CDC43	YGL155W	1131 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	YHR212W-A	YHR212W-A	204 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	YAR061W	YAR061W	204 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	CDC21	YOR074C	915 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	TSL1	YML100W	3297 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	SAP155	YFR040W	3009 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	UTP7	YER082C	1665 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	UGO1	YDR470C	1509 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	VHS1	YDR247W	1386 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	RAT1	YOR048C	3021 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	RPL12A	YEL054C	498 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	PGA3	YML125C	939 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	HRK1	YOR267C	2280 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	TPS3	YMR261C	3165 nt		4.15	□□□□□ -1.74
VAR1	P02381	GLO2	YDR272W	825 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	YER187W	YER187W	426 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	SEC13	YLR208W	894 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	YBL044W	YBL044W	369 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	SAC1	YKL212W	1872 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	HES1	YOR237W	1305 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	CTT1	YGR088W	1689 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	NPY1	YGL067W	1155 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	YML101C-A	YML101C-A	318 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	YPR195C	YPR195C	330 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	MPH2	YDL247W	1830 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	SMF3	YLR034C	1422 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	HOT1	YMR172W	2160 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	HFI1	YPL254W	1467 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	HXT3	YDR345C	1704 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	YTA12	YMR089C	2478 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	FOL1	YNL256W	2475 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	PAL1	YDR348C	1500 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	YDR541C	YDR541C	1035 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	RPL34A	YER056C-A	366 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	NQM1	YGR043C	1002 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	PCT1	YGR202C	1275 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	VMA16	YHR026W	642 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	APM2	YHL019C	1818 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	SHE10	YGL228W	1734 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	YDR154C	YDR154C	351 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	SEN34	YAR008W	828 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	YNR048W	YNR048W	1182 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	PIN2	YOR104W	849 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	ZUO1	YGR285C	1302 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	LEU1	YGL009C	2340 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	ESF1	YDR365C	1887 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	GDB1	YPR184W	4611 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	SOL1	YNR034W	966 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	DCI1	YOR180C	816 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	UBC4	YBR082C	447 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	SUM1	YDR310C	3189 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	TPO2	YGR138C	1845 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	ACF2	YLR144C	2340 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	BRL1	YHR036W	1416 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	HRP1	YOL123W	1605 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	MCM4	YPR019W	2802 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	MDR1	YGR100W	2853 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	VPS72	YDR485C	2388 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	YOR1	YGR281W	4434 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	YHL049C	YHL049C	816 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	MTW1	YAL034W-A	870 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	SHP1	YBL058W	1272 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	SNO4	YMR322C	714 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	HSP33	YOR391C	714 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	HSP32	YPL280W	714 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	DNF2	YDR093W	4839 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	FAA4	YMR246W	2085 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	HFA1	YMR207C	6372 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	MEC3	YLR288C	1425 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	YFL034W	YFL034W	3222 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	DED81	YHR019C	1665 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	GEP3	YOR205C	1671 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	YDL144C	YDL144C	1071 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	COX26	YDR119W-A	201 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	HSX1	tR(CCU)J	72 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	YML131W	YML131W	1098 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	UIP4	YPL186C	915 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VAR1	P02381	MMP1	YLL061W	1752 nt		4.09	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	HIR2	YOR038C	2628 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	BRF1	YGR246C	1791 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	MND2	YIR025W	1107 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	CAF4	YKR036C	1932 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	YLL059C	YLL059C	507 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	TUB3	YML124C	1338 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	YMR135W-A	YMR135W-A	534 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	YPL102C	YPL102C	303 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	YMR196W	YMR196W	3267 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	DAK1	YML070W	1755 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	TRM44	YPL030W	1704 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	MCH4	YOL119C	1506 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	RPT1	YKL145W	1404 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	MDM34	YGL219C	1380 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	YDL034W	YDL034W	345 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	GCS1	YDL226C	1059 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	TFG1	YGR186W	2208 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	ALG2	YGL065C	1512 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	YEF1	YEL041W	1488 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	TGL4	YKR089C	2733 nt		4.06	□□□□□ -1.76

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