Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APBB3O95704 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBB3O95704 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBB3O95704 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APBB3O95704 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBB3O95704 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBB3O95704 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBB3O95704 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBB3O95704 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBB3O95704 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBB3O95704 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBB3O95704 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBB3O95704 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBB3O95704 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APBB3O95704 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBB3O95704 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBB3O95704 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBB3O95704 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBB3O95704 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBB3O95704 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBB3O95704 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBB3O95704 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBB3O95704 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBB3O95704 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBB3O95704 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBB3O95704 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBB3O95704 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APBB3O95704 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBB3O95704 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBB3O95704 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBB3O95704 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBB3O95704 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBB3O95704 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBB3O95704 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBB3O95704 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBB3O95704 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBB3O95704 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB3O95704 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB3O95704 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB3O95704 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB3O95704 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB3O95704 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB3O95704 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB3O95704 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB3O95704 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB3O95704 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB3O95704 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB3O95704 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB3O95704 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB3O95704 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB3O95704 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB3O95704 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB3O95704 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB3O95704 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB3O95704 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB3O95704 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APBB3O95704 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APBB3O95704 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB3O95704 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB3O95704 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB3O95704 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB3O95704 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB3O95704 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB3O95704 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB3O95704 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB3O95704 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB3O95704 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB3O95704 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBB3O95704 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBB3O95704 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBB3O95704 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBB3O95704 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBB3O95704 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBB3O95704 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBB3O95704 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB3O95704 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB3O95704 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB3O95704 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB3O95704 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB3O95704 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB3O95704 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB3O95704 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB3O95704 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB3O95704 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB3O95704 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APBB3O95704 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APBB3O95704 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
APBB3O95704 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
APBB3O95704 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APBB3O95704 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APBB3O95704 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APBB3O95704 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
APBB3O95704 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APBB3O95704 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APBB3O95704 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APBB3O95704 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APBB3O95704 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APBB3O95704 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APBB3O95704 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APBB3O95704 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms