Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PCNTO95613 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCNTO95613 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PCNTO95613 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCNTO95613 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCNTO95613 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCNTO95613 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PCNTO95613 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCNTO95613 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PCNTO95613 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PCNTO95613 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PCNTO95613 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCNTO95613 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCNTO95613 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCNTO95613 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PCNTO95613 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCNTO95613 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCNTO95613 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCNTO95613 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCNTO95613 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCNTO95613 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PCNTO95613 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PCNTO95613 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PCNTO95613 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PCNTO95613 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCNTO95613 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCNTO95613 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCNTO95613 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCNTO95613 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCNTO95613 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PCNTO95613 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PCNTO95613 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCNTO95613 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PCNTO95613 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PCNTO95613 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCNTO95613 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCNTO95613 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCNTO95613 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCNTO95613 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PCNTO95613 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCNTO95613 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCNTO95613 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCNTO95613 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCNTO95613 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCNTO95613 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PCNTO95613 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCNTO95613 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCNTO95613 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCNTO95613 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCNTO95613 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCNTO95613 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCNTO95613 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCNTO95613 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCNTO95613 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCNTO95613 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCNTO95613 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCNTO95613 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PCNTO95613 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCNTO95613 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCNTO95613 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCNTO95613 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCNTO95613 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCNTO95613 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCNTO95613 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCNTO95613 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCNTO95613 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCNTO95613 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCNTO95613 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCNTO95613 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCNTO95613 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCNTO95613 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCNTO95613 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCNTO95613 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCNTO95613 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCNTO95613 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCNTO95613 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCNTO95613 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCNTO95613 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCNTO95613 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCNTO95613 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCNTO95613 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCNTO95613 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCNTO95613 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCNTO95613 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCNTO95613 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PCNTO95613 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCNTO95613 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCNTO95613 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCNTO95613 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCNTO95613 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PCNTO95613 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCNTO95613 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCNTO95613 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCNTO95613 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCNTO95613 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCNTO95613 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCNTO95613 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCNTO95613 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCNTO95613 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCNTO95613 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms