Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNKO75909 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNKO75909 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNKO75909 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNKO75909 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNKO75909 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNKO75909 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNKO75909 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNKO75909 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNKO75909 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNKO75909 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNKO75909 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNKO75909 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNKO75909 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNKO75909 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNKO75909 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNKO75909 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNKO75909 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNKO75909 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNKO75909 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNKO75909 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNKO75909 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNKO75909 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNKO75909 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNKO75909 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCNKO75909 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCNKO75909 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCNKO75909 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNKO75909 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNKO75909 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNKO75909 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNKO75909 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNKO75909 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNKO75909 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNKO75909 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNKO75909 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNKO75909 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNKO75909 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNKO75909 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNKO75909 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNKO75909 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNKO75909 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNKO75909 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNKO75909 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNKO75909 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNKO75909 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNKO75909 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNKO75909 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNKO75909 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNKO75909 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNKO75909 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNKO75909 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNKO75909 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNKO75909 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNKO75909 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNKO75909 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNKO75909 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNKO75909 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNKO75909 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNKO75909 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNKO75909 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNKO75909 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNKO75909 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNKO75909 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNKO75909 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNKO75909 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCNKO75909 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCNKO75909 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCNKO75909 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCNKO75909 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCNKO75909 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCNKO75909 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCNKO75909 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCNKO75909 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCNKO75909 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCNKO75909 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCNKO75909 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCNKO75909 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCNKO75909 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCNKO75909 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCNKO75909 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CCNKO75909 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNKO75909 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNKO75909 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNKO75909 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNKO75909 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNKO75909 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNKO75909 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNKO75909 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNKO75909 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNKO75909 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNKO75909 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNKO75909 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCNKO75909 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNKO75909 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCNKO75909 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCNKO75909 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCNKO75909 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNKO75909 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNKO75909 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms