Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSDE1O75534 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSDE1O75534 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms