Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KERAO60938 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KERAO60938 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KERAO60938 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KERAO60938 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KERAO60938 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KERAO60938 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KERAO60938 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KERAO60938 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KERAO60938 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KERAO60938 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KERAO60938 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KERAO60938 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KERAO60938 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KERAO60938 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KERAO60938 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KERAO60938 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KERAO60938 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KERAO60938 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KERAO60938 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KERAO60938 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KERAO60938 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KERAO60938 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KERAO60938 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KERAO60938 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KERAO60938 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KERAO60938 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KERAO60938 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KERAO60938 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KERAO60938 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KERAO60938 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KERAO60938 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KERAO60938 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KERAO60938 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KERAO60938 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KERAO60938 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KERAO60938 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KERAO60938 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KERAO60938 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KERAO60938 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KERAO60938 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KERAO60938 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KERAO60938 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KERAO60938 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KERAO60938 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KERAO60938 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KERAO60938 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KERAO60938 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KERAO60938 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KERAO60938 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KERAO60938 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KERAO60938 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KERAO60938 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KERAO60938 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KERAO60938 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KERAO60938 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KERAO60938 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KERAO60938 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KERAO60938 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KERAO60938 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KERAO60938 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KERAO60938 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KERAO60938 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KERAO60938 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KERAO60938 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KERAO60938 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KERAO60938 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KERAO60938 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KERAO60938 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KERAO60938 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KERAO60938 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KERAO60938 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KERAO60938 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KERAO60938 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KERAO60938 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KERAO60938 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KERAO60938 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KERAO60938 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KERAO60938 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KERAO60938 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KERAO60938 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KERAO60938 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KERAO60938 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KERAO60938 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KERAO60938 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KERAO60938 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KERAO60938 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KERAO60938 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KERAO60938 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KERAO60938 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KERAO60938 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KERAO60938 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KERAO60938 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KERAO60938 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KERAO60938 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KERAO60938 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KERAO60938 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KERAO60938 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KERAO60938 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KERAO60938 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms