Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP9BO43861 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms