Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP9O43818 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP9O43818 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP9O43818 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP9O43818 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP9O43818 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP9O43818 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP9O43818 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP9O43818 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP9O43818 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP9O43818 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP9O43818 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP9O43818 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP9O43818 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP9O43818 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP9O43818 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP9O43818 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP9O43818 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP9O43818 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP9O43818 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP9O43818 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP9O43818 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP9O43818 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP9O43818 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP9O43818 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP9O43818 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP9O43818 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP9O43818 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP9O43818 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP9O43818 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP9O43818 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP9O43818 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP9O43818 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP9O43818 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP9O43818 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP9O43818 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP9O43818 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP9O43818 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP9O43818 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP9O43818 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP9O43818 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP9O43818 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP9O43818 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP9O43818 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP9O43818 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP9O43818 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP9O43818 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP9O43818 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP9O43818 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP9O43818 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP9O43818 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP9O43818 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP9O43818 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP9O43818 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP9O43818 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP9O43818 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP9O43818 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP9O43818 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP9O43818 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP9O43818 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP9O43818 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP9O43818 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP9O43818 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP9O43818 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP9O43818 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP9O43818 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP9O43818 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP9O43818 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP9O43818 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP9O43818 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP9O43818 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RRP9O43818 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP9O43818 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP9O43818 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP9O43818 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP9O43818 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP9O43818 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP9O43818 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP9O43818 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP9O43818 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP9O43818 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP9O43818 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP9O43818 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP9O43818 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP9O43818 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP9O43818 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP9O43818 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP9O43818 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP9O43818 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP9O43818 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP9O43818 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP9O43818 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP9O43818 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP9O43818 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP9O43818 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP9O43818 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP9O43818 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP9O43818 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP9O43818 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP9O43818 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms