Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRKAB2O43741 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms