Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR3O43731 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms