Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PJA2O43164 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PJA2O43164 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PJA2O43164 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PJA2O43164 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PJA2O43164 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PJA2O43164 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PJA2O43164 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PJA2O43164 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PJA2O43164 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PJA2O43164 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PJA2O43164 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PJA2O43164 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PJA2O43164 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PJA2O43164 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PJA2O43164 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PJA2O43164 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PJA2O43164 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PJA2O43164 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PJA2O43164 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PJA2O43164 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PJA2O43164 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PJA2O43164 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PJA2O43164 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PJA2O43164 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PJA2O43164 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PJA2O43164 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PJA2O43164 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PJA2O43164 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PJA2O43164 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PJA2O43164 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PJA2O43164 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PJA2O43164 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PJA2O43164 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PJA2O43164 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PJA2O43164 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PJA2O43164 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PJA2O43164 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PJA2O43164 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PJA2O43164 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PJA2O43164 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PJA2O43164 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PJA2O43164 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PJA2O43164 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PJA2O43164 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PJA2O43164 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PJA2O43164 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PJA2O43164 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PJA2O43164 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PJA2O43164 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PJA2O43164 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PJA2O43164 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PJA2O43164 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PJA2O43164 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PJA2O43164 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PJA2O43164 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PJA2O43164 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PJA2O43164 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PJA2O43164 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PJA2O43164 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PJA2O43164 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PJA2O43164 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PJA2O43164 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PJA2O43164 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PJA2O43164 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PJA2O43164 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PJA2O43164 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PJA2O43164 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PJA2O43164 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PJA2O43164 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PJA2O43164 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PJA2O43164 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PJA2O43164 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PJA2O43164 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PJA2O43164 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PJA2O43164 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PJA2O43164 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PJA2O43164 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PJA2O43164 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PJA2O43164 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PJA2O43164 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PJA2O43164 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PJA2O43164 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PJA2O43164 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PJA2O43164 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PJA2O43164 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PJA2O43164 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PJA2O43164 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PJA2O43164 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PJA2O43164 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PJA2O43164 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PJA2O43164 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PJA2O43164 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PJA2O43164 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PJA2O43164 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PJA2O43164 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PJA2O43164 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PJA2O43164 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PJA2O43164 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PJA2O43164 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms