Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR2DO15514 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms