Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FANCAO15360 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.73■■■■□ 3.31
FANCAO15360 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FANCAO15360 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
FANCAO15360 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
FANCAO15360 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FANCAO15360 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FANCAO15360 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
FANCAO15360 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FANCAO15360 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
FANCAO15360 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FANCAO15360 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FANCAO15360 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FANCAO15360 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
FANCAO15360 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FANCAO15360 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
FANCAO15360 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FANCAO15360 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
FANCAO15360 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
FANCAO15360 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FANCAO15360 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FANCAO15360 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FANCAO15360 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FANCAO15360 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FANCAO15360 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FANCAO15360 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
FANCAO15360 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FANCAO15360 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
FANCAO15360 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
FANCAO15360 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FANCAO15360 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FANCAO15360 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
FANCAO15360 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FANCAO15360 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
FANCAO15360 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
FANCAO15360 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FANCAO15360 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
FANCAO15360 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
FANCAO15360 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FANCAO15360 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FANCAO15360 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
FANCAO15360 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
FANCAO15360 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FANCAO15360 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FANCAO15360 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FANCAO15360 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
FANCAO15360 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
FANCAO15360 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
FANCAO15360 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
FANCAO15360 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
FANCAO15360 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
FANCAO15360 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
FANCAO15360 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
FANCAO15360 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
FANCAO15360 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
FANCAO15360 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
FANCAO15360 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
FANCAO15360 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
FANCAO15360 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FANCAO15360 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
FANCAO15360 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FANCAO15360 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FANCAO15360 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
FANCAO15360 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
FANCAO15360 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FANCAO15360 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FANCAO15360 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
FANCAO15360 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FANCAO15360 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FANCAO15360 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
FANCAO15360 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FANCAO15360 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FANCAO15360 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FANCAO15360 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FANCAO15360 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FANCAO15360 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
FANCAO15360 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FANCAO15360 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FANCAO15360 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FANCAO15360 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FANCAO15360 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FANCAO15360 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
FANCAO15360 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
FANCAO15360 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FANCAO15360 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
FANCAO15360 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FANCAO15360 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
FANCAO15360 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
FANCAO15360 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FANCAO15360 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FANCAO15360 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FANCAO15360 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FANCAO15360 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FANCAO15360 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FANCAO15360 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
FANCAO15360 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FANCAO15360 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FANCAO15360 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
FANCAO15360 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
FANCAO15360 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms