Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA3EO15041 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA3EO15041 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA3EO15041 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA3EO15041 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA3EO15041 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA3EO15041 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA3EO15041 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA3EO15041 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA3EO15041 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA3EO15041 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA3EO15041 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA3EO15041 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SEMA3EO15041 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA3EO15041 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms