Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBAG9O00559 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBAG9O00559 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms