Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPSO00116 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPSO00116 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPSO00116 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPSO00116 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPSO00116 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPSO00116 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPSO00116 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPSO00116 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPSO00116 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPSO00116 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGPSO00116 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGPSO00116 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGPSO00116 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGPSO00116 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPSO00116 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPSO00116 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPSO00116 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPSO00116 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPSO00116 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPSO00116 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPSO00116 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPSO00116 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPSO00116 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPSO00116 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
AGPSO00116 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
AGPSO00116 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGPSO00116 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGPSO00116 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGPSO00116 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGPSO00116 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGPSO00116 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGPSO00116 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGPSO00116 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGPSO00116 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGPSO00116 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPSO00116 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPSO00116 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPSO00116 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPSO00116 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPSO00116 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPSO00116 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPSO00116 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPSO00116 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPSO00116 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPSO00116 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPSO00116 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPSO00116 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPSO00116 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPSO00116 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPSO00116 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPSO00116 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPSO00116 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPSO00116 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGPSO00116 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGPSO00116 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGPSO00116 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGPSO00116 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGPSO00116 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGPSO00116 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGPSO00116 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGPSO00116 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGPSO00116 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGPSO00116 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGPSO00116 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGPSO00116 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGPSO00116 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGPSO00116 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGPSO00116 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGPSO00116 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGPSO00116 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGPSO00116 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGPSO00116 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGPSO00116 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGPSO00116 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGPSO00116 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
AGPSO00116 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGPSO00116 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGPSO00116 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGPSO00116 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGPSO00116 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGPSO00116 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGPSO00116 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGPSO00116 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGPSO00116 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGPSO00116 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGPSO00116 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGPSO00116 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGPSO00116 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGPSO00116 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGPSO00116 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGPSO00116 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGPSO00116 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGPSO00116 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGPSO00116 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGPSO00116 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGPSO00116 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AGPSO00116 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGPSO00116 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGPSO00116 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms