Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM22K7EJ46 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.51■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.51■■■□□ 2
SMIM22K7EJ46 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms