Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABARAPH6UMI1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPH6UMI1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GABARAPH6UMI1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GABARAPH6UMI1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GABARAPH6UMI1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPH6UMI1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPH6UMI1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPH6UMI1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPH6UMI1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPH6UMI1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPH6UMI1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPH6UMI1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPH6UMI1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPH6UMI1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPH6UMI1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms