Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMX2-CTNND1H3BSU7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms