Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
H3BNC9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H3BNC9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
H3BNC9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
H3BNC9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H3BNC9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BNC9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BNC9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BNC9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BNC9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BNC9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BNC9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BNC9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BNC9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BNC9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BNC9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BNC9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BNC9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BNC9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BNC9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BNC9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BNC9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BNC9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BNC9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BNC9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BNC9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BNC9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BNC9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BNC9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BNC9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BNC9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BNC9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BNC9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BNC9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BNC9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BNC9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BNC9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BNC9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BNC9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BNC9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BNC9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BNC9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNC9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNC9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNC9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNC9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNC9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNC9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNC9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNC9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNC9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNC9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNC9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNC9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNC9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNC9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNC9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BNC9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BNC9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BNC9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BNC9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BNC9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BNC9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BNC9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BNC9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BNC9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BNC9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BNC9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BNC9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BNC9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BNC9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BNC9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BNC9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BNC9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BNC9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BNC9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BNC9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BNC9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BNC9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BNC9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BNC9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BNC9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BNC9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BNC9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BNC9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BNC9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BNC9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BNC9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BNC9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BNC9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BNC9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BNC9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BNC9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BNC9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BNC9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BNC9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BNC9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BNC9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BNC9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BNC9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms