Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPB8E9PQR5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms