Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms